Existen 3 aparcamientos en San Juan de Gaztelugatxe. El primero de ellos se encuentra junto a la carretera de acceso (BI-3101). Se trata de un pequeño aparcamiento de unas 25 plazas que se encuentra ubicado a unos 200 metros del control de aforo de Urizarreta. Si seguimos la carretera dirección al restaurante Eneperi, encontraremos otro aparcamiento, el más grande y el más cercano a San Juan de Gaztelugatxe. Por desgracia este aparcamiento es privado y debemos pagar para poder aparcar nuestro vehículo. El tercer y último aparcamiento se encuentra junto al área de Lurgorri, cerca del control de acceso de Ermu, a unos 15 minutos andando del control de acceso. El aforo total de los aparcamientos en San Juan de Gaztelugatxe asciende a 250 plazas. Aun así, debido a la gran demanda de aparcamiento que existe en temporada alta, los aparcamientos suelen agotarse con facilidad. Sobre todo en horas punta, de 10:00 a 16:00. Os recomendamos madrugar. Recordad que la entrada no incluye plaza de aparcamiento. En caso de que no encontréis ninguna plaza libre, existe la posibilidad de aparcar el coche en Bakio y subir andando.